Храм был уже достроен до купола, и надо было только установить столбы для арок, как в 1853 году появились трещины. Строительство приостановили, а стены разобрали для укрепления фундамента.
18 января 1858 года указом Его Императорского величества была объявлена “повсеместная в Империи подписка для сбора добровольных пожертвований на восстановление и сооружение соборного храма в Пятигорске на месте разрушающегося”. Курировать исполнение монаршего указа был назначен господин обер-прокурор, граф Алексей Петрович Толстой. На восстановительные работы было собрано 12918 р. 19 к. В 1864 году храм был доведен до купола, но для окончания работ не хватило средств. В 1865 году синод выделил дополнительно 10 тысяч рублей.
Храм был выполнен из местного камня, представлял собой огромное сооружение с пятью куполами и имел следующие размеры: высота до среднего креста 15 саженей при длине 13 1/3 сажени.
Строительство завершилось в 1867 году. 31 мая 1869 года Епископ Кавказский и Черноморский Феофилакт (Губин) совершил освящение собора во Имя Христа Спасителя. Собор имел три придела. Один из боковых приделов был освящен в честь Святого Великомученика и целителя Пантелеимона. В 1902 году в соборе был устроен придел во имя Святителя и Чудотворца Николая, освящение которого совершил Преосвященный Владимир, Епископ Владикавказский и Моздокский, 29 августа 1902 года.
Главный алтарный иконостас – резной из дерева, отличался богатством художественной отделки. Внутренние стены собора в значительной своей части были побелены, лишь кое-где на стенах встречались изображения святых. На одной из стен – большое изображение “Воздадите Кесарево – Кесареви, а Божие – Богови”, на другой – Иверский образ Матери Божией.
Центральный барабан собора опирался на четыре мощные четырехгранные колонны. Этот барабан венчал полусферический купол с изображением Христа Спасителя, а на колоннах – четырех апостолов. Из центра потолка свисало огромное паникадило художественной работы.
У главного входа собора в стенных нишах размещались иконы – справа Спасителя, слева – Богородицы. Величиной они были в человеческий рост и составлены из цветных керамических плиток.
С начала XX века собор становится кафедральным для Архиерея Терской области. Перед революцией здесь находилась кафедра Епископа Арсения, потом Епископа Макария, а с первых дней Советской власти и по 30-е годы – архиепископа Мефодия (Абрамкина), расстрелянного в Пятигорской тюрьме в 1937 году.
В разное время настоятелями храма были: протоиерей Михаил Закхеев, его сменяет протоиерей Василий Жуков. Священниками в соборе были Владимир Рождественский, Быстров и др., протодиаконом – Лебединский.
Вплоть до 1902года настоятелем служил протоиерей Василий Эрастов.
В небольшом садике в соборной ограде, недалеко от алтарной части был похоронен в фамильном склепе генерал Евдокимов и его супруга.
В том же соборном садике, в его южном углу, под специально сооруженным навесом, висел огромный, весом в несколько тонн, медно-бронзовый колокол, язык которого приходилось раскачивать двум звонарям. Его благовест был слышен во всех концах города. Его чистый, тягучий звук слышали окраины и пригороды Пятигорска, доносился он даже до селения Юцы.
Собор был закрыт в 30-х годах нашего века. Одно время там была ссыпка зерна. Впоследствии, в 1936 году его стали сносить, но прочность его стен была такова, что пришлось взрывать частями.
Тогда же была разрушена часовня над склепом Евдокимовых. Останки графа и его супруги были перезахоронены на Красно-Слободском кладбище (ныне городское кладбище). Бюст Евдокимова, книга о наградах, полученных покойным от императора, шпага переданы Пятигорскому краеведческому музею, там же находится архиерейское кресло из собора. Некоторые иконы были переданы в Лазаревскую церковь Пятигорска.
Камень, от взорванного собора использовали при постройке нового моста через реку Подкумок в поселке Свободы.
Решение о восстановлении собора было принято в начале 90-х гг. 1 августа 1992 года состоялось освящение места и установлен крест, где было положено начало восстановлению собора Христа Спасителя, Исцеляющего расслабленного у Овчей Купели.